Microbioomtransformatie: hoe u uw darmmicrobioom traint voor gezondheid

Het is vastgesteld dat het darmmicrobioom een ​​essentiële rol speelt in onze gezondheid. Verschillende ziekten, met name ziekten die het maagdarmkanaal aantasten, zoals inflammatoire darmaandoeningen, zijn in verband gebracht met een dysbiose van het microbioom. Voor het doen van diverse tests heeft GC Biotech en Clean NA de nodige laboratorium apparaten. 

Microbioomtransformatie: eerdere therapieën voor het darmmicrobioom en hun problemen 

Een reeds gevestigde behandelmethode op dit gebied is de zogenaamde fecale microbiota transplantatie (FMT), beter bekend als stoelgangtransplantatie. Het gaat om het overbrengen van de ontlasting van een gezonde donor naar de darm van een zieke persoon door middel van endoscopie of in de vorm van capsules. Sinds het begin van de Covid-19-pandemie is FMT echter bijna volledig opgeschort. Het risico op infectie met Covid-19 door fecaal-orale overdracht kan niet worden uitgesloten. 

Microbioomtransformatie: selectief voordeel zonder antibiotica 

Voor ons project is het belangrijk dat ons plasmide niet alleen door de darmbacteriën wordt opgenomen, maar ook permanent in de bacteriepopulatie wordt vastgehouden. Om bacteriën een plasmide te laten behouden, moet het hen een selectief voordeel bieden. Daarom worden in het laboratorium vaak plasmiden gebruikt die een extra antibioticaresistentie bevatten. Omdat ons plasmide in de darm zou moeten worden ingebracht, onthouden we ons van het gebruik van een antibioticumselectie. In plaats daarvan werken we aan een selectief voordeel van de darmbacteriën door middel van voedingssupplementen. In principe kunnen de aanvullende voedingssupplementen alleen worden gemetaboliseerd door de bacteriën die het plasmide hebben opgenomen, waardoor ze een selectief voordeel hebben. In het bijzonder willen we dit selectieve voordeel bereiken door een bèta-agarase en een resulterende afbraak van agar te introduceren. 

Microbioomtransformatie: de problemen en kansen van de microbioomcomplexiteit 

Omdat de hele complexiteit van dit model niet volledig kan worden begrepen en het recreëren van een exacte replica van het microbioom niet mogelijk zal zijn in het wetlab, zullen we simulaties moeten gebruiken en modellen moeten maken op basis van bestaande gegevens. Dit zal worden onderzocht in het drylab, hopelijk leidend tot zinvolle bevindingen die vervolgens een nuttig hulpmiddel kunnen worden voor toekomstige experimenten op dit gebied. De resultaten kunnen bijdragen aan de preventie of behandeling van complexere ziekten zoals obesitas, inflammatoire darmaandoeningen, type II diabetes of colorectale kanker. Er zijn echter nog steeds hiaten in de kennis over de genetische en epigenetische etiologie (onderzoek naar de oorzaak) van deze ziekten, evenals de bijdrage van het darmmicrobioom eraan. Deze kennislacunes vormen belangrijke beperkende factoren bij het ontwerpen van efficiënte therapieën.